Специально уполномоченным органом государственного управления в области организации, охраны и использования природно-заповедного фонда является центральный орган исполнительной власти в области охраны окружающей среды.

Для обеспечения государственного управления территориями и объектами природно-заповедного фонда могут создаваться специальные подразделения центрального органа исполнительной власти в области охраны окружающей среды и его органов на местах.

Управления территориями и объектами природно-заповедного фонда

Управления природными заповедниками, биосферными заповедниками, национальными природными парками, региональными ландшафтными парками, а также ботаническими садами, дендрологических парков и зоологическими парками общегосударственного значения осуществляется их специальными администрациями.
Специальные администрации могут создаваться также для управления ботаническими садами, дендрологические парки, зоологические парками местного значения и парками-памятниками садово-паркового искусства по решению органов, в ведении которых они находятся.

В состав специальной администрации по управлению территориями и объектами природно-заповедного фонда входят соответствующие научные подразделения, службы охраны, хозяйственного и другого обслуживания.
Управления территориями и объектами природно-заповедного фонда, для которых не создаются специальные администрации, осуществляется предприятиями, учреждениями и организациями, в ведении которых находятся эти территории и объекты.

Участие объединений граждан в управлении территориями и объектами природно-заповедного фонда

Объединение граждан, уставами которых предусмотрена деятельность в области охраны окружающей среды, имеющих право на участие в управлении территориями и объектами природно-заповедного фонда путем:
внесение предложений по организации новых территорий и объектов природно-заповедного фонда, обеспечению их охраны, эффективного использования природных комплексов и объектов;
содействие государственным органам в их деятельности в этой сфере;

участия в установленном порядке в проведении экологической экспертизы объектов, отрицательно влияют или могут отрицательно повлиять на состояние территорий и объектов природно-заповедного фонда;
участия в контроле за соблюдением режима таких территорий и объектов;
осуществление в соответствии с законодательством Украины других мероприятий, предусмотренных их уставами.